Meisner äußert sich auch zum Scheitern des Forschungsprojekts mit dem Kriminologischen Forschungsinstitut Niedersachsen zur Aufarbeitung der Missbrauchsfälle in der katholischen Kirche: Er bedaure "den Vertrauensverlust", der dadurch entstanden sei. Zugleich bekräftigte er, die Bischöfe würden "mit einem anderen unabhängigen Institut die Studie unbedingt fortsetzen".